RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592275.5

USP36-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 4

Gene USP36, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-222	ENST00000592275	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	C19orf84	I3L1E1	186 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CHRM3	P20309	590 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	AGA	P20933	346 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CUL1	Q13616	776 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	GPR137	Q96N19	417 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CYTH2	Q99418	400 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	OR2W5	A6NFC9	320 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275		H7BY64	318 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	KIF5C	O60282	957 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	AVIL	O75366	819 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	IL1RN	P18510	177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	KCNJ1	P48048	391 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	RHAG	Q02094	409 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	BTBD16	Q32M84	506 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP36-222	ENST00000592275		E5RI56	91 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	BCL6	P41182	706 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	XCR1	P46094	333 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	AVPR1B	P47901	424 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	TBPL1	P62380	186 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	PTK6	Q13882	451 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	SGK494	L7N484	410 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	PFDN6	O15212	129 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	NEURL1	O76050	574 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	UQCRH	P07919	91 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	COX6B1	P14854	86 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	HRH2	P25021	359 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	CD96	P40200	585 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	SLC1A2	P43004	574 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	MAGEA3	P43357	314 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	AGTR2	P50052	363 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP36-222	ENST00000592275	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28

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