RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 CTSFQ9UBX1 484 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 ACOT9Q9Y305 439 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.07□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 A0A087X1B8 175 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 WDR54Q9H977 334 aa13.06□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 A0A096LPK6 155 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 TRBC2A0A5B9 178 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 HMX2A2RU54 273 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 A6NL46 340 aa13.05□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 PELI2Q9HAT8 420 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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CTIF-207ENST00000589585 B8ZZF3 427 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 FOXS1O43638 330 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 STK16O75716 305 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-207ENST00000589585 ZGLP1P0C6A0 271 aa13.04□□□□□ -0.32
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