RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 RMND5AQ9H871 391 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 AURKCQ9UQB9 309 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP13Q12802 2813 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FFAR3O14843 346 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR42O15529 346 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PGRP06401 933 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA6P08133 673 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM18P0DKX4 95 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 BCKDHAP12694 445 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 GGT1P19440 569 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CCR5P51681 352 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ADPRHP54922 357 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 POLE2P56282 527 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMG2Q02383 582 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 LRIF1Q5T3J3 769 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 LIPIQ6XZB0 460 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TSC22D3Q99576 134 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ACPTQ9BZG2 426 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF639Q9UID6 485 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 VILLO15195 856 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 AHCYL1O43865 530 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RASAL1O95294 804 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CATP04040 527 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FESP07332 822 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSLP07711 333 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 IL1RNP18510 177 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PAX7P23759 505 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP2P42575 452 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 C21orf58P58505 322 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ELP6Q0PNE2 266 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 NHSL2Q5HYW2 709 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf52Q5T4I8 152 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 GLYATQ6IB77 296 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SLCO6A1Q86UG4 719 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 STARD8Q92502 1023 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CNBD2Q96M20 576 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A18Q96N87 628 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCG8Q9H221 673 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA3Q9NST1 481 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SLAMF8Q9P0V8 285 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SUFUQ9UMX1 484 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFHX4Q86UP3 3567 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SPEGQ15772 3267 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A096LPI6 279 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FLRT2O43155 660 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SCELO95171 688 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 LDLRP01130 860 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PDYNP01213 254 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HRH2P25021 359 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HNF4AP41235 474 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 MYBPC1Q00872 1141 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HMGCS1Q01581 520 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 APOFQ13790 326 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL7AQ4VC05 210 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FRG2Q64ET8 278 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAMP4Q969E2 229 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ10AQ96MF6 247 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM74Q96NL1 305 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FRG2BQ96QU4 278 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC29A1Q99808 456 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CIB1Q99828 191 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 BDH2Q9BUT1 245 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 CD84Q9UIB8 345 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 KNL1Q8NG31 2342 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 H0Y8X5 98 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT9AO14904 365 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA12O60330 932 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT1P04628 370 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ELFN1P0C7U0 828 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV3P41162 512 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 E2F2Q14209 437 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXB2Q5VYV0 432 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 NEK5Q6P3R8 708 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 VRK3Q8IV63 474 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 PHC3Q8NDX5 983 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 NAT14Q8WUY8 206 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 NCSTNQ92542 709 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TFAP2CQ92754 450 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM159Q96B96 161 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF583Q96ND8 569 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 HAUS8Q9BT25 410 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-204ENST00000587718 UGT2B28Q9BY64 529 aa24.53■■□□□ 1.52
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