RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 TAC3Q9UHF0 121 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 PRKACGP22612 351 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 GALNT2Q10471 571 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 OR3A2P47893 321 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 H0YGN5 161 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 INMTO95050 263 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 AGR2O95994 175 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 PQLC3Q8N755 202 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRM-211ENST00000580170 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 CH25HO95992 272 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ACTR1BP42025 376 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ACTR1AP61163 376 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRM-211ENST00000580170 ASB3Q9Y575 518 aa20.72■□□□□ 0.91
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