RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	DNAJB6	O75190	326 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	JRK	O75564	520 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	GMPR	P36959	345 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	VSNL1	P62760	191 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	DSG2	Q14126	1118 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C17orf64	Q86WR6	236 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FBXL8	Q96CD0	374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	OR2W5	A6NFC9	320 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	IDS	B3KWA1	339 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	DPM1	O60762	260 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	HRH2	P25021	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MAGEA4	P43358	317 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	OCA2	Q04671	838 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FAM53B	Q14153	422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	RBBP7	Q16576	425 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MVB12A	Q96EY5	273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	DRC3	Q9H069	523 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	FAM155B	O75949	473 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	KLHL18	O94889	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	B3GALT4	O96024	378 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	IGHE	P01854	428 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	GSTA2	P09210	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	IL1RN	P18510	177 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	ITGA3	P26006	1051 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	EMP2	P54851	167 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	AP1S2	P56377	157 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SGK494	L7N484	410 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TXNDC9	O14530	226 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	BMP10	O95393	424 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CELA2A	P08217	269 aa		13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	MYBL2	P10244	700 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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