RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJC9Q8WXX5 260 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ITCHQ96J02 903 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRGUKQ96M69 825 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 NRTNQ99748 197 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3GL1Q99961 368 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa27.33■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 KDM1AO60341 852 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP6V1B2P21281 511 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC7A1P30825 629 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCR8P51685 355 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 REEP5Q00765 189 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 UGT8Q16880 541 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 RUNDC3AQ59EK9 446 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 VN1R5Q7Z5H4 357 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAMKMTQ7Z624 323 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR180Q86V85 440 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSRB3Q8IXL7 192 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF740Q8NDX6 193 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM8Q9BZR9 551 aa27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 DFNA5O60443 496 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR3DL1P43629 444 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 MUM1Q2TAK8 710 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 METTL4Q8N3J2 472 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52E1Q8NGJ3 308 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.966e-11■■■■■ 32.3
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACAT2Q9BWD1 397 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 VCX3BQ9H321 246 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX13Q9Y5W8 968 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52A4PA6NMU1 304 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PEX1O43933 1283 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAPNS1P04632 268 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFS1P28331 727 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPN6P29350 595 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 RABIFP47224 123 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ICE2Q659A1 982 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARMCX6Q7L4S7 300 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPEM1Q8N4L4 309 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D29Q9UFV1 150 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIMS3Q9UJD0 308 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 AP4S1Q9Y587 144 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARPC2O15144 300 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCN2BO60939 215 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPC1P48995 793 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRP54P61011 504 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT33BQ14525 404 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP2R1Q6VVX0 501 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXL6Q8N531 539 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2A1Q8NGT9 310 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CXorf40BQ96DE9 158 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 IER2Q9BTL4 223 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ICKQ9UPZ9 632 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 DGKBQ9Y6T7 804 aa27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRATO95237 230 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SELPLGQ14242 412 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF11Q15544 211 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGS1Q32NB8 556 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6ZSR6 202 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 COMMD6Q7Z4G1 85 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PROSER1Q86XN7 944 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLCO4A1Q96BD0 722 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 EGFL7Q9UHF1 273 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP8B1Q9UNU6 501 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP4O75096 1905 aa27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDH7O60245 1069 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEMA3DO95025 777 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 TGFB1P01137 390 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACADSP16219 412 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMB5P28074 263 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRIA3P42263 894 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 WNT3P56703 355 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTPNP58546 118 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALG11Q2TAA5 492 aa27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANO7Q6IWH7 933 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms