RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395		H0YIV9	168 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FLRT2	O43155	660 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WISP1	O95388	367 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF883	P0CG24	379 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NPPB	P16860	134 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRPH2	P23942	346 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PKLR	P30613	574 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PGM1	P36871	562 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NUDT2	P50583	147 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	THOP1	P52888	689 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	DIO3	P55073	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NME5	P56597	212 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC25A3	Q00325	362 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HMGCS1	Q01581	520 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF33B	Q06732	778 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRKG2	Q13237	762 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TEAD4	Q15561	434 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RPE65	Q16518	533 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IMPG1	Q17R60	797 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SGO1	Q5FBB7	561 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ATG9B	Q674R7	924 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PAOX	Q6QHF9	649 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LCTL	Q6UWM7	567 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NEIL2	Q969S2	332 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HAUS8	Q9BT25	410 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	EHD1	Q9H4M9	534 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ASIC5	Q9NY37	505 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PCM1	Q15154	2024 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PPV9	198 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		A6NCN8	305 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		A8MUI8	341 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395		B8ZZF3	427 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NR5A2	O00482	541 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FBP2	O00757	339 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	AIM2	O14862	343 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SCAMP1	O15126	338 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MGRN1	O60291	552 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC22A3	O75751	556 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RASGRP1	O95267	797 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NTRK1	P04629	796 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	THEGL	P0DJG4	465 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CDH1	P12830	882 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HSD3B1	P14060	373 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC2A4	P14672	509 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ACPP	P15309	386 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HSD3B2	P26439	372 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25

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