RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FIG4	Q92562	907 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0B4J203	849 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CYR61	O00622	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CPLX1	O14810	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR1	O75083	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LDB3	O75112	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IRF2	P14316	349 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF23	P17027	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CCNA2	P20248	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AHCY	P23526	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MMP13	P45452	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HTD2	P86397	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	DSC1	Q08554	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRAF3	Q13114	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PDK1	Q15118	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CALCRL	Q16602	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0G2JNG1	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321		H0YIG0	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PLOD2	O00469	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNJ13	O60928	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SOCS5	O75159	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KDM4B	O94953	1096 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ACP2	P11117	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	SCP2	P22307	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	PIK3R1	P27986	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	USP8	P40818	1118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	MAGEB1	P43366	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RABIF	P47224	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	OR3A1	P47881	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ISL1	P61371	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CX3CL1	P78423	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	GAMT	Q14353	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-210	ENST00000556321	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms