RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	E2F2	Q14209	437 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ASPG	Q86U10	573 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	OR7G3	Q8NG95	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	OR6C1	Q96RD1	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SARG	Q9BW04	601 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM60A	Q9NP50	221 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ITM2A	O43736	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	NRP2	O60462	931 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ULK1	O75385	1050 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2B3	O76000	313 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FOLR1	P15328	257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SCTR	P47872	440 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ITGA1	P56199	1179 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CLDN6	P56747	220 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB15	P59190	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CYP4F2	P78329	520 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PWP1	Q13610	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	IL11RA	Q14626	422 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR19	Q15760	415 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FAR2	Q96K12	515 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1B0GTL3	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	URAD	A6NGE7	173 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904		B4E171	279 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904		H0YGG7	62 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	PLD2	O14939	933 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	CLEC3A	O75596	197 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	FGF4	P08620	206 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TSPAN7	P41732	249 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	HK2	P52789	917 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	SKP1	P63208	163 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TGM3	Q08188	693 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	GRM7	Q14831	915 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	IMPG1	Q17R60	797 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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