RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXCR2P25025 360 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GABRB3P28472 473 aa18.45■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYS1Q717R9 158 aa18.45■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf90Q96M02 699 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OLAHQ9NV23 265 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED16Q9Y2X0 877 aa18.45■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PQ72 361 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDH17O14917 1159 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINA7P05543 415 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR35P0CG20 571 aa18.44■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CUL1Q13616 776 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DSG2Q14126 1118 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RELL1Q8IUW5 271 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPATCH11Q8N954 259 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD200R1Q8TD46 325 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDKL2Q92772 493 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HAS2Q92819 552 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDNQ99608 321 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACAT2Q9BWD1 397 aa18.44■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALPQ9UBC7 116 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCA12Q86UK0 2595 aa18.44■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IDSB3KWA1 339 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYO1CO00159 1063 aa18.43■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AHSGP02765 367 aa18.43■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERGP11308 486 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX6A1P12074 109 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSTR1P30872 391 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOX11P35716 441 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEA4P43358 317 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFSF10P50591 281 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPX6P59796 221 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC26A11Q86WA9 606 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM45AQ8TCE6 357 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.43■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SVILO95425 2214 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZG16O60844 167 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8GP07360 202 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSTA2P09210 222 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC26A3P40879 764 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL2P60568 153 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RELAQ04206 551 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INAQ16352 499 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAQR7Q86WK9 346 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.42■□□□□ 0.54
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.42■□□□□ 0.54
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