RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 PLK4O00444 970 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 DVL1O14640 695 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 CCL16O15467 120 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 TEX28O15482 410 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 ZBTB43O43298 467 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 GRID2O43424 1007 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 EXTL3O43909 919 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 CTSVO60911 334 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 RPS6KA5O75582 802 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 SP1P08047 785 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF23P17027 643 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 NR2F2P24468 414 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 PPP2R2BQ00005 443 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC43Q8N309 656 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF843Q8N446 348 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 HES6Q96HZ4 224 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 DACH2Q96NX9 599 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC22A12Q96S37 553 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 EPYCQ99645 322 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 RGS18Q9NS28 235 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 NEDD4P46934 1319 aa4.91□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 MYLKQ15746 1914 aa4.9□□□□□ -1.62
AC009396.1-201ENST00000553628 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A0G2JNG1 304 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LNP1A1A4G5 178 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ADAM12O43184 909 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PDE9AO76083 593 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 DDHD2O94830 711 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GCNT3O95395 438 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MMP9P14780 707 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PRLRP16471 622 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MT3P25713 68 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TIMP3P35625 211 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC15A1P46059 708 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MFAP4P55083 255 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CLDN6P56747 220 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PHEXP78562 749 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 KIR2DS5Q14953 304 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TMTC2Q8N394 836 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CLDN23Q96B33 292 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MOAP1Q96BY2 351 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SDF4Q9BRK5 362 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 HRH4Q9H3N8 390 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS28Q9UK41 221 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM131Q92545 1883 aa4.9□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 FLNCQ14315 2725 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A1W2PQ09 198 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 PRSS47A8MTI9 375 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 BMP10O95393 424 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF806P0C7X5 589 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 GJA1P17302 382 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CEBPBP17676 345 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 NMBRP28336 390 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 CCND2P30279 289 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 MMP15P51511 669 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 HSD17B4P51659 736 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 LIMK1P53667 647 aa4.89□□□□□ -1.63
AC009396.1-201ENST00000553628 TERF1P54274 439 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms