RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 KATNA1O75449 491 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 OR2B3O76000 313 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ACSL3O95573 720 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GUCA1CO95843 209 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DDAH2O95865 285 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 C8GP07360 202 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ERGP11308 486 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TCN2P20062 427 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HIST1H2ADP20671 130 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CYP2A7P20853 494 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 F8A1P23610 371 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HSD3B2P26439 372 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 IMPA1P29218 277 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ECHS1P30084 290 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CMPK1P30085 196 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 STX2P32856 288 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DLSTP36957 453 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HSD17B2P37059 387 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GP5P40197 560 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GABRA4P48169 554 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ITGA1P56199 1179 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 POU4F1Q01851 419 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TAP2Q03519 686 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ABHD18Q0P651 414 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GPS2Q13227 327 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GRTP1Q5TC63 336 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 IFT20Q8IY31 132 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 GPR135Q8IZ08 494 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ESX1Q8N693 406 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 OR8K5Q8NH50 307 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 STARD8Q92502 1023 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CCDC138Q96M89 665 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 FMO2Q99518 471 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 DPH7Q9BTV6 452 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 LHX9Q9NQ69 397 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 EURLQ9NYK6 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 CROTQ9UKG9 612 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YVX5 310 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ZNF839A8K0R7 811 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TARM1B6A8C7 271 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CTSVO60911 334 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MT-ND3P03897 115 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MSL3P1P0C860 447 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ADH6P28332 368 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PHBP35232 272 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 STAT5AP42229 794 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NAE1Q13564 534 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MAP7Q14244 749 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ICE2Q659A1 982 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 LCN10Q6JVE6 187 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 MR1Q95460 341 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PYCR2Q96C36 320 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 RUFY1Q96T51 708 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 GPR22Q99680 433 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-217ENST00000550044 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms