RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	IRF8	Q02556	426 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TLE3	Q04726	772 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF844	Q08AG5	666 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TBCC	Q15814	346 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	XKR6	Q5GH73	641 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ASPG	Q86U10	573 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TRABD2A	Q86V40	505 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TEX9	Q8N6V9	391 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	UBE2E3	Q969T4	207 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC126	Q96EE4	140 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	WDR34	Q96EX3	536 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	MVB12A	Q96EY5	273 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	NT5DC2	Q9H857	520 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	MKS1	Q9NXB0	559 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		21.43	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	21.42	■■□□□ 1.02	1e-6	■■□□□ 12.7
PUF60-222	ENST00000533362	CTSB	P07858	339 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SCTR	P47872	440 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SLC18A2	Q05940	514 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RGS1	Q08116	209 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PCDH1	Q08174	1060 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PWP1	Q13610	501 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	IQCK	Q8N0W5	287 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TRPV3	Q8NET8	790 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RDH11	Q8TC12	318 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	PHF21B	Q96EK2	531 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SMC6	Q96SB8	1091 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GPR87	Q9BY21	358 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	STARD5	Q9NSY2	213 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CROT	Q9UKG9	612 aa		21.42	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	MYZAP	P0CAP1	466 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ALAS2	P22557	587 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DLST	P36957	453 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CASP2	P42575	452 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GTF2H2	Q13888	395 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	APOPT1	Q96IL0	206 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GBP5	Q96PP8	586 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RUFY1	Q96T51	708 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	COPG2	Q9UBF2	871 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	ASB1	Q9Y576	335 aa		21.41	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SPTB	P11277	2137 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	URAD	A6NGE7	173 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362		A8MT66	165 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	NDUFS4	O43181	175 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	UGDH	O60701	494 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	LIF	P15018	202 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	TCN2	P20062	427 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SERPINB1	P30740	379 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	NAA20	P61599	178 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	SKP1	P63208	163 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	MC1R	Q01726	317 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	CHIT1	Q13231	466 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DNASE1L3	Q13609	305 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	DOC2A	Q14183	400 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	HKDC1	Q2TB90	917 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	C1orf189	Q5VU69	101 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	C16orf46	Q6P387	395 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		21.4	■■□□□ 1.02
PUF60-222	ENST00000533362	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		21.4	■■□□□ 1.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms