RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CAV1	Q03135	178 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CSHL1	Q14406	222 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	EGFL8	Q99944	293 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SEC16A	O15027	2179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	FANCG	O15287	622 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TP73	O15350	636 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RAD51C	O43502	376 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR1F1	O43749	312 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CYC1	P08574	325 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	IL1RN	P18510	177 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	BCL6	P41182	706 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	HNMT	P50135	292 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PGGT1B	P53609	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CBLB	Q13191	982 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393		Q8NA96	180 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFS4	O43181	175 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	WFS1	O76024	890 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	BMP10	O95393	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPIND1	P05546	499 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GSTA2	P09210	222 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	COX6A1	P12074	109 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ICAM2	P13598	275 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GNLY	P22749	145 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	SSTR1	P30872	391 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	GLRB	P48167	497 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TAS2R39	P59534	338 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CDKL1	Q00532	357 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	POU4F1	Q01851	419 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	RGS1	Q08116	209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PWP1	Q13610	501 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF460	Q14592	562 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	HERC3	Q15034	1050 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393		Q6ZS92	163 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RBBP4-215	ENST00000524393	CPNE1	Q99829	537 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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