RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	INPP5D	Q92835	1189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RFT1	Q96AA3	541 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ESAM	Q96AP7	390 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RASL10B	Q96S79	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMO	Q9BU70	441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB33B	Q9H082	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GKN1	Q9NS71	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PIGV	Q9NUD9	493 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TAF1	P21675	1872 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE4B	O95155	1302 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MBD5	Q9P267	1494 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A087X0K7	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PPK0	400 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		F8VVB4	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		F8VWA3	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A2	O15244	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMD3	O43242	534 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	LDB2	O43679	373 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PLCH2	O75038	1416 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFS7	O75251	213 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6A2	O95222	327 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	T-ENOL	P0DO92	83 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SFTPC	P11686	197 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	IRF2	P14316	349 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GNLY	P22749	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-F	P30511	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR3A1	P47881	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HYAL1	Q12794	435 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX1	Q13596	522 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF284	Q2VY69	593 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT14P1	Q58G82	188 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM166A	Q6J272	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH26	Q8IXH8	852 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	THAP8	Q8NA92	274 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTR8	Q9H981	624 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RAI14	Q9P0K7	980 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81	1e-6	■■■■□ 22.1
FAM49B-222	ENST00000522702	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KDR	P35968	1356 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81

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