RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CD200R1Q8TD46 325 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PEX13Q92968 403 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC138Q96M89 665 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 HBEGFQ99075 208 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CDYLQ9Y232 598 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPN13Q12923 2485 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM131Q92545 1883 aa6.28□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0J9YY10 115 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ARGFXA6NJG6 315 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 J3QW42 95 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFS4O43181 175 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SGTAO43765 313 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 B4GALT2O60909 372 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ATE1O95260 518 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 C2P06681 752 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 THRAP10827 490 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF28P17035 718 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 RAP1GDS1P52306 607 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CDH13P55290 713 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 BTKQ06187 659 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ABHD18Q0P651 414 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP97Q8IW35 865 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX9Q8N6V9 391 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF480Q8WV37 535 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.27□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 COL4A2P08572 1712 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 UBXN8O00124 270 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM24O75264 130 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SPAG7O75391 227 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ERLIN1O75477 346 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNA16P05015 189 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TNNI3P19429 210 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGA3P26006 1051 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NFATC3Q12968 1075 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 STARD8Q92502 1023 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 EPN3Q9H201 632 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 EMC7Q9NPA0 242 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR27Q9NS67 375 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF69Q9UC07 566 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CROTQ9UKG9 612 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE10AQ9Y233 779 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 PLXNA2O75051 1894 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2W5A6NFC9 320 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 B3GALT4O96024 378 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM87AP0C7U9 286 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RHCEP18577 417 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GPX6P59796 221 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 VSNL1P62760 191 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 IRF9Q00978 393 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 RHDQ02161 417 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB134Q4QY38 66 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GRTP1Q5TC63 336 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 SZRD1Q7Z422 152 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.27□□□□□ -1.41
RRN3P1-201ENST00000514813 ATL1Q8WXF7 558 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms