RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRC3	Q9H069	523 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5AR2	Q9P296	337 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf18	Q9UK00	162 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN13	Q12923	2485 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRK2	Q5S007	2527 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC9	O14530	226 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPM1	O60762	260 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHE	P01854	428 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2AD	P20671	130 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMPR	P36959	345 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A5	Q01650	507 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	OCA2	Q04671	838 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HPS6	Q86YV9	775 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCT2	Q8NC54	265 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEIL2	Q969S2	332 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOCOS	Q96EN8	888 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR22	Q99680	433 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBBP8	Q99708	897 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFRP	Q9BY79	579 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	OARD1	Q9Y530	152 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESYT3	A0FGR9	886 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	IDS	B3KWA1	339 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	JRK	O75564	520 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM155B	O75949	473 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	BMP10	O95393	424 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX6A1	P12074	109 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1RN	P18510	177 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEA4	P43358	317 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A12	P48065	614 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCR8	P51685	355 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKL1	Q00532	357 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	POU4F1	Q01851	419 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBBP7	Q16576	425 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM205	Q6UW68	189 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASPG	Q86U10	573 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATL1	Q8WXF7	558 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPNE1	Q99829	537 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	DERL2	Q9GZP9	239 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB17	Q9H0T7	212 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPAM	Q9HCL2	828 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LUZP4	Q9P127	313 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBC2	A0A5B9	178 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YIG0	161 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGK494	L7N484	410 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAPBP	O15533	448 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48	2e-6	■□□□□ 8.6

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