RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 UBE2E3Q969T4 207 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 MVB12AQ96EY5 273 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 CUTCQ9NTM9 273 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 COPG2Q9UBF2 871 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 KCND3Q9UK17 655 aa25.62■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 OR1F1O43749 312 aa25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP69BQ9UJL9 534 aa25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 TGIF1Q15583 401 aa25.6■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZIM3Q96PE6 472 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 TM4SF19Q96DZ7 209 aa25.59■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 GBP5Q96PP8 586 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 RUFY1Q96T51 708 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa25.58■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB1P30740 379 aa25.58■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 CHIT1Q13231 466 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
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SH3BP2-212ENST00000508338 TTLL10Q6ZVT0 673 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 VN1R4Q7Z5H5 301 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 C4orf33Q8N1A6 199 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 STARD5Q9NSY2 213 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB1Q9Y576 335 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-212ENST00000508338 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-212ENST00000508338 WFS1O76024 890 aa25.57■■□□□ 1.68
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