RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 AOAHP28039 575 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PCSK6P29122 969 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PREPP48147 710 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KRT6CP48668 564 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 METAP1P53582 386 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FOXM1Q08050 763 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MESP2Q0VG99 397 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PGS1Q32NB8 556 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZNF786Q8N393 782 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 APOLD1Q96LR9 279 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR52E6Q96RD3 313 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LYSMD1Q96S90 227 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CHID1Q9BWS9 393 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EBPLQ9BY08 206 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ACPTQ9BZG2 426 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SLC32A1Q9H598 525 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SMOXQ9NWM0 555 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQF6 199 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM170BA6NMN3 283 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AGAP14A8MT82 685 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PLK4O00444 970 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 VILLO15195 856 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF4O60810 478 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KCNH1O95259 989 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PGRP06401 933 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NNMTP40261 264 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CTSCP53634 463 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 IST1P53990 364 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AHI1Q8N157 1196 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ANKFN1Q8N957 763 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MED8Q96G25 268 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FBXL20Q96IG2 436 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 C1orf109Q9NX04 203 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 A6NL46 340 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC28A1O00337 649 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GMNNO75496 209 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 B3GALNT1O75752 331 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LDLRP01130 860 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CTSLP07711 333 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EBLN1P0CF75 366 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HLA-EP13747 358 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MSH3P20585 1137 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ACP1P24666 158 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VIPR2P41587 438 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GSSP48637 474 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PWP1Q13610 501 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPIDRQ14159 915 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CACUL1Q86Y37 369 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR2T12Q8NG77 320 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GTF2H4Q92759 462 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NCLNQ969V3 563 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NTMT1Q9BV86 223 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANTXRLA6NF34 631 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 H3BSA7 217 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DLGAP1O14490 977 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN6O43657 245 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C1QCP02747 245 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms