RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ST7LQ8TDW4 575 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 THAP9Q9H5L6 903 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RAB9BQ9NP90 201 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 BMPR1BO00238 502 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CD59P13987 128 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH1B1P30837 517 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PHEXP78562 749 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY6Q15077 328 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK11Q15759 364 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ACKR1Q16570 336 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP6Q5VW22 663 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 GIMAP5Q96F15 307 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 SIX2Q9NPC8 291 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRC-212ENST00000491302 CCL24O00175 119 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1B1P05026 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SBK2P0C263 348 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA11P43364 429 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB1P43366 347 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DNA2P51530 1060 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DLX5P56178 289 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PPA1Q15181 289 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 STXBP2Q15833 593 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD11Q693B1 232 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SUSD6Q92537 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LMLNQ96KR4 655 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF559Q9BR84 538 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC1Q9NV70 894 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 EXTL3O43909 919 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CLPTM1O96005 669 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SGCGQ13326 291 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM29Q14134 588 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 FGD3Q5JSP0 725 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LRTM2Q8N967 370 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 DYRK2Q92630 601 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 LPAR4Q99677 370 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 APPL1Q9UKG1 709 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SCN5AQ14524 2016 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087X0K7 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB16A2A368 324 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 E5RGE8 158 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH7O60245 1069 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 GRAP2O75791 330 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RAF1P04049 648 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 PRKAR1AP10644 381 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM29Q86T20 159 aa6.87□□□□□ -1.31
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