RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487500.2

RPL7-208, Transcript of ribosomal protein L7, human

TSL 1 (best)

Gene RPL7, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell body (neuron), Dendrite .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL7-208	ENST00000487500	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CPT1B	Q92523	772 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PGM2	Q96G03	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MIS12	Q9H081	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CWH43	Q9H720	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SYT5	O00445	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	GMNN	O75496	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	JRK	O75564	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	DIRAS3	O95661	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FTCD	O95954	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MT-ND5	P03915	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CYC1	P08574	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RALB	P11234	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ACADM	P11310	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MLN	P12872	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ICAM2	P13598	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	KLRC1	P26715	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RPA1	P27694	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	GSTM2	P28161	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SERPINF1	P36955	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	FOLR3	P41439	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MAGEA1	P43355	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CDKN1B	P46527	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	GABRB2	P47870	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NXPH1	P58417	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	SHC2	P98077	582 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RELA	Q04206	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	GPS1	Q13098	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	DRP2	Q13474	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PGM5	Q15124	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	NPTX1	Q15818	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL7-208	ENST00000487500	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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