RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.13□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 AKAP6Q13023 2319 aa6.13□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A0J9YVX5 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM187AA6NFU0 413 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 E7ESA3 106 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TP73O15350 636 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 NRP2O60462 931 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ONECUT2O95948 504 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ALBP02768 609 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 C8GP07360 202 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ITGAXP20702 1163 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ALAS2P22557 587 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IMPA1P29218 277 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SSTR2P30874 369 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CASQ1P31415 396 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OTX2P32243 289 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IST1P53990 364 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RRADP55042 308 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CDKN2DP55273 166 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNK10P57789 538 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ABATP80404 500 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SP140Q13342 867 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP1A4Q13733 1029 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC9A5Q14940 896 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ICE2Q659A1 982 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM198Q66K66 360 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF425Q6IV72 752 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZS92 163 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MED25Q71SY5 747 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 COX15Q7KZN9 410 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MRGPREQ86SM8 312 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PAQR7Q86WK9 346 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PALM2Q8IXS6 379 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 GPATCH11Q8N954 259 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 BBOF1Q8ND07 529 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PRR14Q9BWN1 585 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR83Q9NYM4 423 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TAC3Q9UHF0 121 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX24Q9Y343 169 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCA4P78363 2273 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HCFC1P51610 2035 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1B0GUH1 482 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HYKKA2RU49 373 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM221AA4D161 298 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 H0YGG7 62 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PEX12O00623 359 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC16A5O15375 505 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RAD51CO43502 376 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IGHEP01854 428 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 UMODP07911 640 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 EDN3P14138 238 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FDXRP22570 491 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HRH2P25021 359 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IL2P60568 153 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TBPL1P62380 186 aa6.11□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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