RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 CXCR2P25025 360 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GRIA3P42263 894 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 LSSP48449 732 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 INHBCP55103 352 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CSNK1G2P78368 415 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 REEP5Q00765 189 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CFHR1Q03591 330 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 BTKQ06187 659 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRIM73Q86UV7 250 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 LAS2Q8IYD9 372 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KRT78Q8N1N4 520 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NT5DC2Q9H857 520 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KCNK13Q9HB14 408 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SNX7Q9UNH6 387 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SNX6Q9UNH7 406 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MANBAO00462 879 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FFAR3O14843 346 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GPR42O15529 346 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SNX3O60493 162 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KRT6AP02538 564 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KRT6BP04259 564 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CKMT2P17540 419 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ITPKBP27987 946 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CD1CP29017 333 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 KRT6CP48668 564 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 HTR6P50406 440 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SQSTM1Q13501 440 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NAA25Q14CX7 972 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 IRGCQ6NXR0 463 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MED27Q6P2C8 311 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SPATA21Q7Z572 469 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PIGWQ7Z7B1 504 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PAQR7Q86WK9 346 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR7G3Q8NG95 312 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 IFI44Q8TCB0 444 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NCSTNQ92542 709 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 USP7Q93009 1102 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PPM1MQ96MI6 270 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CCDC3Q9BQI4 270 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SARGQ9BW04 601 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NUF2Q9BZD4 464 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SPTBP11277 2137 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRBC2A0A5B9 178 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 SERTM1A2A2V5 107 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 OR2A25A4D2G3 310 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TLCD2A6NGC4 264 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 PIP5K1BO14986 540 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 NRP2O60462 931 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 C9P02748 559 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 MAGP20916 626 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ACP1P24666 158 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CSF2RBP32927 897 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 AQP5P55064 265 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 GFERP55789 205 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ZNF33BQ06732 778 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 CAMK2BQ13554 666 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 AMZ1Q400G9 498 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FRG2Q64ET8 278 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 FCRL6Q6DN72 434 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 EPGNQ6UW88 154 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1-209ENST00000484048 ADCK2Q7Z695 626 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms