RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483881.1

PKP4-212, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 452 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-212ENST00000483881 PTERQ96BW5 349 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 DHRS9Q9BPW9 319 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TMEM47Q9BQJ4 181 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CALN1Q9BXU9 219 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 KRT23Q9C075 422 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 LHPPQ9H008 270 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SNX25Q9H3E2 840 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TUFT1Q9NNX1 390 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CYSLTR2Q9NS75 346 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 COX16Q9P0S2 106 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 C5AR2Q9P296 337 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NARFQ9UHQ1 456 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TINAGQ9UJW2 476 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 STX8Q9UNK0 236 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CHMP2BQ9UQN3 213 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 HEY1Q9Y5J3 304 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 A3GALT2U3KPV4 340 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ZFYVE9O95405 1425 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CEP152O94986 1710 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CNTNAP1P78357 1384 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PNPLA6Q8IY17 1366 aa2.99□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 MROH2AA6NES4 1674 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ELP1O95163 1332 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ACEP12821 1306 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NLRP1Q9C000 1473 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 A0A0U1RQF3 1178 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 GOLGA8OA6NCC3 632 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 LIPT2A6NK58 231 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SNTNA6NMZ2 147 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 AGAP14A8MT82 685 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 GOLGA8NF8WBI6 632 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 K7ERQ8 282 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 MAP2K7O14733 419 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TO15178 435 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 HCRTR2O43614 444 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 BUB1O43683 1085 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PI15O43692 258 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 KRT86O43790 486 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PAGE4O60829 102 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SMIM24O75264 130 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 MED24O75448 989 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SUPT3HO75486 399 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 JRKO75564 520 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SERPINB7O75635 380 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ATP5HO75947 161 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 RGS11O94810 467 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SOX30O94993 753 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 SEMA3DO95025 777 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 GCNT3O95395 438 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 LCA5LO95447 670 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CLDN7O95471 211 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 FYNP06241 537 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 RALAP11233 206 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CKMT2P17540 419 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CYP3A5P20815 502 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 ALDH4A1P30038 563 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 HMOX2P30519 316 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 HOXC9P31274 260 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 DCTDP32321 178 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PSMB10P40306 273 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 RGS2P41220 211 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 CCR10P46092 362 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 RABIFP47224 123 aa2.98□□□□□ -1.93
PKP4-212ENST00000483881 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms