RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 WDR48Q8TAF3 677 aa20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 MIEF2Q96C03 454 aa20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 AURKCQ9UQB9 309 aa20.91■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 YY2O15391 372 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 LAMP1P11279 417 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 ASMTP46597 345 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 CTBSQ01459 385 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 TCEA2Q15560 299 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 KRT78Q8N1N4 520 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 GABRR3A8MPY1 467 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 C10orf142B7Z368 130 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 H7BY64 318 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 KLHL18O94889 574 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 GBAP04062 536 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PKLRP30613 574 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 RAB28P51157 221 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 CYP51A1Q16850 503 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 GLYATQ6IB77 296 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PROSER1Q86XN7 944 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 C10orf111Q8N326 155 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 NELL1Q92832 810 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 WDR92Q96MX6 357 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.9■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.89■□□□□ 0.94
USP13-202ENST00000482333 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 RFXANKO14593 260 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 SEMA4FO95754 770 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 EML2O95834 649 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 CCR8P51685 355 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 TDGQ13569 410 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 KRT33BQ14525 404 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 TBCELQ5QJ74 424 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 OR2T12Q8NG77 320 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 BIRC7Q96CA5 298 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 SH3GL1Q99961 368 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 RHBGQ9H310 441 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ICKQ9UPZ9 632 aa20.89■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 GPIP06744 558 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 GGT1P19440 569 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PGBD3Q8N328 593 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 METTL4Q8N3J2 472 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 CCDC115Q96NT0 180 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 GBP5Q96PP8 586 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 FEZF1A0PJY2 475 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 APBB3O95704 486 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 C1QCP02747 245 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 CHRNB1P11230 501 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 PHEXP78562 749 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 REEP5Q00765 189 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 MTX3Q5HYI7 312 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ANO7Q6IWH7 933 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.88■□□□□ 0.93
USP13-202ENST00000482333 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms