RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 ICKQ9UPZ9 632 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 POMPQ9Y244 141 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1W2PR77 199 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PIPSLA2A3N6 862 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 K7ESF4 209 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 NR5A2O00482 541 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PDE5AO76074 875 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 WNT1P04628 370 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PRPS2P11908 318 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SDC1P18827 310 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SLC6A2P23975 617 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PIK3CBP42338 1070 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RABIFP47224 123 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RAB28P51157 221 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 THOP1P52888 689 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 MXRA7P84157 204 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 MTAPQ13126 283 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ART3Q13508 389 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 LAPTM5Q13571 262 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 FXNQ16595 210 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 MED27Q6P2C8 311 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 LIX1Q8N485 282 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RLN3Q8WXF3 142 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 VPS33AQ96AX1 596 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 HAUS8Q9BT25 410 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SARGQ9BW04 601 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PELI2Q9HAT8 420 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 BRD7Q9NPI1 651 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 CMTM6Q9NX76 183 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PRORSD1PA6NEY8 169 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 NME4O00746 187 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SCAMP1O15126 338 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SCN2BO60939 215 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 NPPAP01160 153 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 CDH1P12830 882 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 HTR1BP28222 390 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ADH6P28332 368 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PTPN6P29350 595 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 GCKP35557 465 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 DGKQP52824 942 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 REEP5Q00765 189 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 FOXM1Q08050 763 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RPS6KA2Q15349 733 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 SNCBQ16143 134 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 IYDQ6PHW0 289 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 PJA1Q8NG27 643 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA6-210ENST00000475302 TESCQ96BS2 214 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms