RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	FEV	Q99581	238 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	BCL9	O00512	1426 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CRLF1	O75462	422 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TADA2A	O75478	443 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	NXPH2	O95156	264 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ACSL3	O95573	720 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	IRF2	P14316	349 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	EPCAM	P16422	314 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CD27	P26842	260 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	OPRL1	P41146	370 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	VAMP7	P51809	220 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	LIMK1	P53667	647 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CLDN15	P56746	228 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	DRP2	Q13474	957 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	VEZF1	Q14119	521 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TOMM20	Q15388	145 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	NPTX1	Q15818	432 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	VGLL1	Q99990	258 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	PAK5	Q9P286	719 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CRB1	P82279	1406 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.27	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	UBE2C	O00762	179 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	EPHB6	O15197	1021 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MMP12	P39900	470 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC6	O95255	1503 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PR80	420 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CLDN4	O14493	209 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	P4HA2	O15460	535 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	MYBL1	P10243	752 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	BDNF	P23560	247 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CPT2	P23786	658 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CSNK2B	P67870	215 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	EXT1	Q16394	746 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF74	Q16587	644 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73

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