RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MYO10Q9HD67 2058 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRIOO75962 3097 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PP55 124 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 A6NCN8 305 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PLOD2O00469 737 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLGNO14967 610 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KMOO15229 486 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA3DO95025 777 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EGFP01133 1207 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LAMP1P11279 417 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FCGR1AP12314 374 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CKMT2P17540 419 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KELP23276 732 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NTSR1P30989 418 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 S100A3P33764 101 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WASP42768 502 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ASMTP46597 345 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CHN2P52757 468 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADPRHP54922 357 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1024LP59773 190 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 REEP5Q00765 189 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD18Q0P651 414 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GAB1Q13480 694 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MED21Q13503 144 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2H3Q13889 308 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GK3PQ14409 553 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IMPG1Q17R60 797 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DUOXA1Q1HG43 343 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF385BQ569K4 471 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SPIN4Q56A73 249 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TBCELQ5QJ74 424 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CPZQ66K79 652 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GLYATQ6IB77 296 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MED27Q6P2C8 311 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 USP30Q70CQ3 517 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA11Q86U17 422 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HORMAD1Q86X24 394 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 YAF2Q8IY57 180 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 METTL4Q8N3J2 472 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PJA1Q8NG27 643 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR2T12Q8NG77 320 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TFAP2CQ92754 450 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FOPNLQ96NB1 174 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IL17FQ96PD4 163 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
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PTPRC-210ENST00000462363 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AICDAQ9GZX7 198 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RMI1Q9H9A7 625 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PELI2Q9HAT8 420 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SGK2Q9HBY8 427 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PREBQ9HCU5 417 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MYNNQ9NPC7 610 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.43□□□□□ -1.54
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