RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 DDAH2O95865 285 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LDLRP01130 860 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 AHSGP02765 367 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ITGAMP11215 1152 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CDH1P12830 882 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 COL8A1P27658 744 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SOX11P35716 441 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 RELAQ04206 551 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SP140Q13342 867 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 FAM53BQ14153 422 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PCGF5Q86SE9 256 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C17orf64Q86WR6 236 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PSMF1Q92530 271 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PYCR2Q96C36 320 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C5orf34Q96MH7 638 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TGIF2Q9GZN2 237 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PARVBQ9HBI1 364 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 DYTNA2CJ06 578 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 OR2W5A6NFC9 320 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SGK494L7N484 410 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 WFS1O76024 890 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 BMP10O95393 424 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CLDN1O95832 211 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SERPINA7P05543 415 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ELK3P41970 407 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TMEM205Q6UW68 189 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 ASPGQ86U10 573 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 KCT2Q8NC54 265 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 OLFM1Q99784 485 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-202ENST00000414620 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.71□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CACNA1DQ01668 2161 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 A0A1W2PQ72 361 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 H0YIG0 161 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SLC16A5O15375 505 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 GUCA1CO95843 209 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 TSPAN12O95859 305 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HIST1H2ADP20671 130 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HRH2P25021 359 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 IVDP26440 423 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 XCR1P46094 333 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 FAR1Q8WVX9 515 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SLCO2A1Q92959 643 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 NAT9Q9BTE0 207 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SGPP1Q9BX95 441 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.062e-23■■■□□ 15.6
ACTB-202ENST00000414620 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ARL15Q9NXU5 204 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.69□□□□□ -0.06
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