RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 GKP32189 559 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CBSP35520 551 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PREPP48147 710 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PGGT1BP53609 377 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CBFBQ13951 182 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C4orf46Q504U0 113 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF627Q7L945 461 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MAP3K8P41279 467 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 HYAL2Q12891 473 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 GPR17Q13304 367 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NATD1Q8N6N6 113 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NFAT5O94916 1531 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 FANCGO15287 622 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C6orf47O95873 294 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 HSDL2Q6YN16 418 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CEP76Q8TAP6 659 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NANOGQ9H9S0 305 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 KDELR3O43731 214 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CDH11P55287 796 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TUBA4AP68366 448 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PTGR1Q14914 329 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CD244Q9BZW8 370 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.75□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ITGA10O75578 1167 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ECHS1P30084 290 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 BLKP51451 505 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF404Q494X3 552 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF773Q6PK81 442 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 Q6ZVL8 140 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 KCNK6Q9Y257 313 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ABCB7O75027 752 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PRH1P02810 166 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PHC1P78364 1004 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ARFRP1Q13795 201 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 RAB8BQ92930 207 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MUS81Q96NY9 551 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF639Q9UID6 485 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 RNF6Q9Y252 685 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 C5orf51A6NDU8 294 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SDHDO14521 159 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC11A1P49279 550 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 DNAJB13P59910 316 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 PREBQ9HCU5 417 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 MTMR11A4FU01 709 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 J3QLW9 94 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 EPOP01588 193 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 HLA-DPB1P04440 258 aa14.74□□□□□ -0.05
UBXN2B-201ENST00000399598 TACSTD2P09758 323 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms