RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPV1Q8NER1 839 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NEK7Q8TDX7 302 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MKS1Q9NXB0 559 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MYH6P13533 1939 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOP08100 348 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH3A2P51648 485 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP69Q49AA0 526 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GRHL3Q8TE85 626 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SYT11Q9BT88 431 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FABP12A6NFH5 140 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM189A1O60320 539 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CNMDO75829 334 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 UBXN7O94888 489 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CH25HO95992 272 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ACADVLP49748 655 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCN7P51798 805 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM7Q14002 265 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TOR3AQ9H497 397 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TLR4O00206 839 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXB2P14652 356 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RHCGQ9UBD6 479 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 KMOO15229 486 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OAZ2O95190 189 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX14O95416 240 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNA6P05013 189 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS56P0CW18 603 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 EMC10Q5UCC4 262 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF186Q9NXI6 227 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 NATD1Q8N6N6 113 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CHST4Q8NCG5 386 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 BTN3A3O00478 584 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX28O15482 410 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 EDIL3O43854 480 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF130Q86XS8 419 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CAMKVQ8NCB2 501 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A075B6Q4 140 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 E2F2Q14209 437 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1E2P47887 323 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ARSFP54793 590 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 SP140Q13342 867 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GLYATL1Q969I3 302 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 XKR8Q9H6D3 395 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 MED31Q9Y3C7 131 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 GNALP38405 381 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 RANBP10Q6VN20 620 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 HMGN1P05114 100 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP4BP51164 291 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 COLEC12Q5KU26 742 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 IDNKQ5T6J7 187 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 LCN1P1Q5VSP4 162 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-202ENST00000392011 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms