RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 HKDC1Q2TB90 917 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF404Q494X3 552 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 FRG2Q64ET8 278 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CHST9Q7L1S5 443 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 IFNL1Q8IU54 200 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 LYSMD2Q8IV50 215 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 FRG2BQ96QU4 278 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 M0R082 166 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CCNKO75909 580 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 DNAJB5O75953 348 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ALOX5P09917 674 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PRPS2P11908 318 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 NKX3-2P78367 333 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CAP1Q01518 475 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 COPS8Q99627 209 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ASNA1O43681 348 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 KRT75O95678 551 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 IGHA2P01877 340 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GALTP07902 379 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 AOAHP28039 575 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP5CP53041 499 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 IFITM2Q01629 132 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 IRF8Q02556 426 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PLD4Q96BZ4 506 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ITPKCQ96DU7 683 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CASD1Q96PB1 797 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 RRAGCQ9HB90 399 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.62■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TET1Q8NFU7 2136 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 INPPL1O15357 1258 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TLL1O43897 1013 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 WNT3P56703 355 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ABRQ12979 859 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 MTA1Q13330 715 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 XKR6Q5GH73 641 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 MACC1Q6ZN28 852 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC5A8Q8N695 610 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC38A4Q969I6 547 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CENPOQ9BU64 300 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 OR2AG2A6NM03 316 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 POU1F1P28069 291 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CRATP43155 626 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PPP3CCP48454 512 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ACLYP53396 1101 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CRYBA2P53672 197 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CDH12P55289 794 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GPR162Q16538 588 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 NAGSQ8N159 534 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SPEGQ15772 3267 aa16.61■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 J3KTA2 159 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CTDSP2O14595 271 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PCDH7O60245 1069 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 UPK1BO75841 260 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 CD22P20273 847 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 BMPR1AP36894 532 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 MXD1Q05195 221 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 PROX2Q3B8N5 592 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SERPINA11Q86U17 422 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 RHCGQ9UBD6 479 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GFRA2O00451 464 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SUV39H1O43463 412 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 C9P02748 559 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 FKBP1BP68106 108 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 GAB1Q13480 694 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 SIX5Q8N196 739 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.6■□□□□ 0.25
SEPHS1-201ENST00000327347 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms