RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HID1Q8IV36 788 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OXR1Q8N573 874 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 FAR2Q96K12 515 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 C12orf66Q96MD2 445 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SLC6A18Q96N87 628 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ASB2Q96Q27 587 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OR4K3Q96R72 315 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 C1orf50Q9BV19 199 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 POLG2Q9UHN1 485 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 VPS13AQ96RL7 3174 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 KNL1Q8NG31 2342 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM64BA6NI03 449 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 E7EQ34 232 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM38O00635 465 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SH3BGRLO75368 114 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OTCP00480 354 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 PCYT1AP49585 367 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 AP1S2P56377 157 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NFATC4Q14934 902 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 CLCA4Q14CN2 919 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 XKR8Q9H6D3 395 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.2□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HGFP14210 728 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TEAD1P28347 426 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 GGT5P36269 586 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HNMTP50135 292 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TBPL1P62380 186 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HMGCS1Q01581 520 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM145Q8NBT3 493 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TFAP2CQ92754 450 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 WDR92Q96MX6 357 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 FERD3LQ96RJ6 166 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 AKAP10O43572 662 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HK2P52789 917 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NFATC3Q12968 1075 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 CAMK2BQ13554 666 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 PTK2BQ14289 1009 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ALG11Q2TAA5 492 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 GJD3Q8N144 294 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 NUDT8Q8WV74 236 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 HPS1Q92902 700 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 ASB9Q96DX5 294 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 OR2M4Q96R27 311 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 CTRCQ99895 268 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 KLF15Q9UIH9 416 aa11.19□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM64A6NGJ6 449 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 UBDO15205 165 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 SLC22A2O15244 555 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 APBB3O95704 486 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 IGLV3-19P01714 112 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 GNAO1P09471 354 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 C7P10643 843 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 CD22P20273 847 aa11.18□□□□□ -0.62
CDCA8-201ENST00000327331 PSMB5P28074 263 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms