RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306888.6

LNX1-202, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNX1, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-202ENST00000306888 A0A1W2PQU0 124 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RASAL1O95294 804 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 APBB3O95704 486 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SEMG1P04279 462 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ATP6V1B1P15313 513 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 IDSP22304 550 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 HPCAL1P37235 193 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MAGEA2P43356 314 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RANBP1P43487 201 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MTPNP58546 118 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SGCGQ13326 291 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 EOGTQ5NDL2 527 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CPZQ66K79 652 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 YY1AP1Q9H869 796 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 GPR27Q9NS67 375 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 IL1RL1Q01638 556 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PRKCQQ04759 706 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 VEZF1Q14119 521 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CYP51A1Q16850 503 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CARM1Q86X55 608 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.36□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 DLGAP1O14490 977 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RAB28P51157 221 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ABATP80404 500 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 EME1Q96AY2 570 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 EGLN2Q96KS0 407 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RDH12Q96NR8 316 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TSSK3Q96PN8 268 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 REEP4Q9H6H4 257 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 GABRR3A8MPY1 467 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 UPK1AO00322 258 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 RFXANKO14593 260 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PCDH7O60245 1069 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 HPRP00739 348 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 FURINP09958 794 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 NUDT1P36639 197 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CDKN2CP42773 168 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 CHN2P52757 468 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 YPEL5P62699 121 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 NFATC4Q14934 902 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 PDK3Q15120 406 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 TTLQ8NG68 377 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 NUDT8Q8WV74 236 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 INPP5KQ9BT40 448 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 MS4A8Q9BY19 250 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.35□□□□□ -1.23
LNX1-202ENST00000306888 INVSQ9Y283 1065 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms