RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 TMEM74Q96NL1 305 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 OR51B5Q9H339 312 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ALG2Q9H553 416 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 RMND5AQ9H871 391 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NANOGQ9H9S0 305 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 H7BY64 318 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 AKAP10O43572 662 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 CCNDBP1O95273 360 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 BAG2O95816 211 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 COX7A2P14406 83 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 HPCAL1P37235 193 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 KIR3DL1P43629 444 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PXNP49023 591 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 GSK3BP49841 420 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 CYP4F2P78329 520 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PLIN5Q00G26 463 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 MTAPQ13126 283 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PGS1Q32NB8 556 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PARGQ86W56 976 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NRROSQ86YC3 692 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 GJD3Q8N144 294 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PJA1Q8NG27 643 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 DNAJB8Q8NHS0 232 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 LCN9Q8WX39 176 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NELL1Q92832 810 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 TRIM15Q9C019 465 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 RHBGQ9H310 441 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NT5DC2Q9H857 520 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 SIRT5Q9NXA8 310 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.09□□□□□ -0.79
COPS2-201ENST00000299259 H3BNX3 289 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 DFNA5O60443 496 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 DNAJA2O60884 412 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 SEMA3DO95025 777 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 C8BP07358 591 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 MTPNP58546 118 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 CSNK1G2P78368 415 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 ABATP80404 500 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 LIPEQ05469 1076 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 FZD2Q14332 565 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 UGT8Q16880 541 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 HKDC1Q2TB90 917 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 GPR180Q86V85 440 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 DHFR2Q86XF0 187 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 METTL4Q8N3J2 472 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 OR2L3Q8NG85 312 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 GPBAR1Q8TDU6 330 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 KLHDC7BQ96G42 594 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 ITCHQ96J02 903 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 LRGUKQ96M69 825 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 MS4A8Q9BY19 250 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 KCNH6Q9H252 994 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 MUC13Q9H3R2 512 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 OR6C2Q9NZP2 312 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 VAPAQ9P0L0 249 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 A0A096LPI6 279 aa10.07□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.07□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 TRBC2A0A5B9 178 aa10.07□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 FEZF1A0PJY2 475 aa10.07□□□□□ -0.8
COPS2-201ENST00000299259 STK25O00506 426 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms