RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 RNF44Q7L0R7 432 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SNX20Q7Z614 316 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 C17orf64Q86WR6 236 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 HMGB4Q8WW32 186 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PROX1Q92786 737 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 RAB8BQ92930 207 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 LMLNQ96KR4 655 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ZNF347Q96SE7 839 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SLC30A3Q99726 388 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TAC3Q9UHF0 121 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.39□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SOBPA7XYQ1 873 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ACOT8O14734 319 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SLC28A2O43868 658 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 KLK1P06870 262 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CD1DP15813 335 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TNFRSF1BP20333 461 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 RRM2P31350 389 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 HTR2BP41595 481 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SEMA3AQ14563 771 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 STK11Q15831 433 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 BCL2A1Q16548 175 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 NDUFA5Q16718 116 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SCML4Q8N228 414 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PGBD5Q8N414 524 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ASB9Q96DX5 294 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 H3BSH0 61 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 KDELR3O43731 214 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 NPHS1O60500 1241 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 POP7O75817 140 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 APOL3O95236 402 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 APOA1P02647 267 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CSF2P04141 144 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CA3P07451 260 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SLC6A2P23975 617 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 HTR1BP28222 390 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SLC7A1P30825 629 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 S100A5P33763 92 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 BMPR1AP36894 532 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 GRIN2CQ14957 1233 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 MED22Q15528 200 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 KDM1BQ8NB78 822 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 MAP6Q96JE9 813 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 NLNQ9BYT8 704 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 KLHL1Q9NR64 748 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 C1orf109Q9NX04 203 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 M0QZQ0 153 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 GRID2O43424 1007 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 GSRP00390 522 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 FCGR1AP12314 374 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 BPIP17213 487 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CXCR2P25025 360 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PPP2R1BP30154 601 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ACTR1BP42025 376 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 ACTR1AP61163 376 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 SCAPQ12770 1279 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 RFX4Q33E94 735 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.38□□□□□ -1.23
USPL1-201ENST00000255304 CPA6Q8N4T0 437 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms