RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A14Q9UN76 642 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ67 120 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 C9JVG2 144 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 UPK1AO00322 258 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL22O00626 93 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ENGP17813 658 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA3P25788 255 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CD38P28907 300 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD12P35452 270 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ETV3P41162 512 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 YBX1P67809 324 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
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CAPNS1-201ENST00000246533 AFTPHQ6ULP2 937 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 USP45Q70EL2 814 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4FQ8N1N0 589 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF555Q8NEP9 628 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX37Q96LM6 180 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF347Q96SE7 839 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 HGH1Q9BTY7 390 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.45■■□□□ 1.67
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP3O75074 770 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB7O75635 380 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 GGT1P19440 569 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA3AQ14563 771 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD2Q4W5G0 525 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRG1LQ5T0D9 272 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TBPL2Q6SJ96 375 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR3Q6TCH7 311 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZVL8 140 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TMBIM1Q969X1 311 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 IL21RQ9HBE5 538 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB9Q9UBS3 223 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SUSD2Q9UGT4 822 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CD84Q9UIB8 345 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX11Q9Y5W9 270 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFALSP35858 605 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOX1Q15067 660 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13H1Q8NG92 308 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP76Q8TAP6 659 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM74Q96NL1 305 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM22Q9Y584 194 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF846Q147U1 533 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 DLEU7Q6UYE1 221 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDH3P22223 829 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ELK4P28324 431 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 OCA2Q04671 838 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC15A4Q8N697 577 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 G3V2T6 193 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EPI3 171 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP33O14559 1287 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS26AO75436 327 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS3O75489 264 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 TFPTP0C1Z6 253 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP2P42575 452 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 YAP1P46937 504 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD7P51665 324 aa25.42■■□□□ 1.66
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