RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059619.1

Cdc42ep1-201, Transcript of Cdc42 effector protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cdc42ep1, Length 2,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Timmdc1Q8BUY5 285 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Crlf2Q8CII9 359 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Wnt9aQ8R5M2 365 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Olfr695Q8VFM3 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Elovl6Q920L5 267 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Mgat4cQ9D306 478 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Exoc2Q9D4H1 924 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Vnn3Q9QZ25 500 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 St6galnac4Q9R2B6 360 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 CitP49025 2055 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Col4a3Q9QZS0 1669 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Pm20d2A3KG59 431 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Mterf1bB9EJ57 379 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm8281L7N235 204 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm8050L7N2E3 205 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm17174M0QWQ9 212 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 GzmcP08882 248 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 DcnP28654 354 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Btbd1P58544 488 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Tmem207P86045 143 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ccdc185Q3V118 621 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Coq8bQ566J8 533 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Mup20Q5FW60 181 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 RbfaQ6P3B9 350 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 HaaoQ78JT3 286 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 SnupnQ80W37 358 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cpped1Q8BFS6 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Txnl4bQ8BUH1 149 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Q8R3C1 574 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Olfr77Q8VEY9 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Pcdhb2Q91Y00 799 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Marveld3Q9D956 376 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Praf2Q9JIG8 178 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Nudt5Q9JKX6 218 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Dnajb7Q9QYI8 312 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Stub1Q9WUD1 304 aa14.64□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Tanc1Q0VGY8 1856 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Sdccag3A2AIW0 432 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 4930402K13RikB1AW18 415 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Trim30bE9PVL6 203 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Olfr544E9PX47 334 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Btbd16E9Q173 522 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm20441G3UYJ7 252 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Shisa8J3QNX5 399 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cops3O88543 423 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 TktP40142 623 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Nr2f6P43136 390 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Sox2P48432 319 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cav3P51637 151 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 StamP70297 548 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ankdd1bQ14DN9 521 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Mrgprb1Q3UG61 350 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Afap1l2Q5DTU0 825 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Olfr392Q7TRX6 312 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Slc43a2Q8CGA3 568 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Vmn1r51Q8VIC6 319 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 DdoQ922Z0 341 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cryl1Q99KP3 319 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Trip4Q9QXN3 581 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Dmrtb1A2A9I7 359 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Prss56F2YMG0 604 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm3327F7C9A1 213 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 H2-T24F8VQG4 363 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 ChadO55226 358 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Hmx2P43687 273 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Barhl1P63157 327 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ext2P70428 718 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 GaaP70699 953 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Pgap1Q3UUQ7 922 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Tas2r106Q7M724 308 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Nars2Q8BGV0 477 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Rdh13Q8CEE7 334 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Tmem125Q8CHQ6 216 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Noxa1Q8CJ00 444 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Zdhhc3Q8R173 299 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Taf12Q8VE65 161 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Chmp1b1Q99LU0 199 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Pbld2Q9CXN7 288 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Wwp2Q9DBH0 870 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 LactbQ9EP89 551 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ggps1Q9WTN0 300 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Arih2Q9Z1K6 492 aa14.63□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Ttc39aA2ACP1 578 aa14.62□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm7694J3QNH8 270 aa14.62□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Vmn2r117K7N6V1 857 aa14.62□□□□□ -0.07
Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 Gm8229K7N749 213 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.8 ms