RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635970.1

CLN8-209, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 1,958 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-209ENST00000635970 EID2BQ96D98 161 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FAM122AQ96E09 287 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 MUS81Q96NY9 551 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 LYSMD1Q96S90 227 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 NANOGQ9H9S0 305 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 HMG20AQ9NP66 347 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CD84Q9UIB8 345 aa15.01□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 A0A1B0GVT2 93 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 STX16O14662 325 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CRCPO75575 148 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 EPOP01588 193 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ALOX5P09917 674 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 THRBP10828 461 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 MTHFD2P13995 350 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 TSPAN8P19075 237 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 HLA-DPA1P20036 260 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CRHBPP24387 322 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CD38P28907 300 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 AKT2P31751 481 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 BNC1Q01954 994 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PFKFB4Q16877 469 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 DUOXA1Q1HG43 343 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 WSCD2Q2TBF2 565 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 XAF1Q6GPH4 301 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 Q6ZVL8 140 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 SDCCAG3Q96C92 435 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 COQ10AQ96MF6 247 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CAPN10Q9HC96 672 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 A0A1W2PR77 199 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 LNP1A1A4G5 178 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CLDN25C9JDP6 229 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PCCBP05166 539 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ALPLP05186 524 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FGF1P05230 155 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZNF806P0C7X5 589 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 UROSP10746 265 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 JAK1P23458 1154 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ERVK-8P63133 956 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PLCL1Q15111 1095 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 BMFQ96LC9 184 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 RNF145Q96MT1 663 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 MROQ9BYG7 248 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 DERL2Q9GZP9 239 aa15□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 SNX2O60749 519 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 GMNNO75496 209 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 LINC00032P0C843 101 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZNF30P17039 623 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 NUDT1P36639 197 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 STC1P52823 247 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 TRIM16LQ309B1 348 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 XKR7Q5GH72 579 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 RABL3Q5HYI8 236 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 GLYATQ6IB77 296 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 IFNEQ86WN2 208 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 OR13H1Q8NG92 308 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CEP76Q8TAP6 659 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ASB12Q8WXK4 309 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 NUS1Q96E22 293 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 DTD2Q96FN9 168 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 VMP1Q96GC9 406 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CCDC138Q96M89 665 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FAM186AA6NE01 2351 aa14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 K7ESM1 405 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PSMD11O00231 422 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 HRH2P25021 359 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 HALP42357 657 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 FOXA1P55317 472 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CHRNB3Q05901 458 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 PRKG2Q13237 762 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 ITGADQ13349 1161 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 OXA1LQ15070 435 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 AGERQ15109 404 aa14.98□□□□□ -0.01
CLN8-209ENST00000635970 CSRP2Q16527 193 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms