RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 FEZF1A0PJY2 475 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 TRIM38O00635 465 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ZW10O43264 779 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 OR1F1O43749 312 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 SEC22BO75396 215 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 NT5DC2Q9H857 520 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 C1orf109Q9NX04 203 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ARMCX1Q9P291 453 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 PADI4Q9UM07 663 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 A0A0J9YY10 115 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 HAT1O14929 419 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 NAA25Q14CX7 972 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 NR0B2Q15466 257 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ZNF425Q6IV72 752 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 OGFOD2Q6N063 350 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 IRGCQ6NXR0 463 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 PAQR7Q86WK9 346 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 PLD3Q8IV08 490 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 EID2Q8N6I1 236 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 TTLQ8NG68 377 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 C1orf50Q9BV19 199 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 RHBGQ9H310 441 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 POMT2Q9UKY4 750 aa8.49□□□□□ -1.05
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XIST-211ENST00000635841 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.49□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 RP1P56715 2156 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 DMDP11532 3685 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 USP34Q70CQ2 3546 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 NRP2O60462 931 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 SH3BGRLO75368 114 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 KIAA0754O94854 1291 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 UBOX5O94941 541 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 RETP07949 1114 aa8.48□□□□□ -1.05
XIST-211ENST00000635841 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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