RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 PCM1Q15154 2024 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF621Q6ZSS3 439 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ELMOD1Q8N336 334 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ALPK1Q96QP1 1244 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF347Q96SE7 839 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2AJQ99878 128 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 H2AFJQ9BTM1 129 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OR2AG2A6NM03 316 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A5O15375 505 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 EPN2O95208 641 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CCR2P41597 374 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 BCAP31P51572 246 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RELAQ04206 551 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FPGSQ05932 587 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CLCA4Q14CN2 919 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ELMO1Q92556 727 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM169Q96HH4 297 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PITX2Q99697 317 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 NEURL2Q9BR09 285 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 NPC1O15118 1278 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 LILRB3O75022 631 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 GSTM1P09488 218 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2A7P20853 494 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ETV3P41162 512 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 NCS1P62166 190 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CD300CQ08708 224 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM215Q68D42 235 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM25Q86YD3 366 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CDC26Q8NHZ8 85 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF558Q96NG5 402 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SLC46A2Q9BY10 475 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 GPATCH2Q9NW75 528 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 GABRR3A8MPY1 467 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 EVPLLA8MZ36 301 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 TGM5O43548 720 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO2B1O94956 709 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 URODP06132 367 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 BDKRB1P46663 353 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PREPP48147 710 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CTSCP53634 463 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 AP1S2P56377 157 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF385BQ569K4 471 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 XKR6Q5GH73 641 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 TPT1P8Q9HAU6 139 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 RASSF1Q9NS23 344 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CREBZFQ9NS37 354 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 HPCAL1P37235 193 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 MVDP53602 400 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CXCR4P61073 352 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB103AP81534 67 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 IRF8Q02556 426 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 LIPJQ5W064 366 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZVL8 140 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 FAM9CQ8IZT9 166 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SETD9Q8NE22 299 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 DNASE1L2Q92874 299 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 VMP1Q96GC9 406 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SH2B3Q9UQQ2 575 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PRAMEF25A6NGN4 478 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
C9orf170-201ENST00000623052 LCKP06239 509 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms