RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 VPS50Q96JG6 964 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SGPP1Q9BX95 441 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.39■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 27
PPP1CC-211ENST00000620030 IL2P60568 153 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CSNK1G2P78368 415 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CBLBQ13191 982 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 NAE1Q13564 534 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HIF1AQ16665 826 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TM9SF4Q92544 642 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf60Q96EN9 201 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SNF8Q96H20 258 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 LHPPQ9H008 270 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 DRC3Q9H069 523 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF14Q9UBS8 474 aa22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FFAR3O14843 346 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR42O15529 346 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HPP00738 406 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 NPPBP16860 134 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FDXRP22570 491 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PAFAH1B1P43034 410 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 EMP2P54851 167 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ARL4CP56559 192 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 IQCKQ8N0W5 287 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 GPATCH11Q8N954 259 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 C8orf44Q96CB5 159 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 THAP11Q96EK4 314 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 AGAP4Q96P64 663 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 OLFM1Q99784 485 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A1W2PQ72 361 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 IDSB3KWA1 339 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ACPPP15309 386 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 NDUFA9Q16795 377 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 SYT16Q17RD7 645 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 LCTLQ6UWM7 567 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 DOCK10Q96BY6 2186 aa22.36■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 E7ESA3 106 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 STATHP02808 62 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ANXA5P08758 320 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HIST1H2ADP20671 130 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CCND1P24385 295 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CUZD1Q86UP6 607 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 C17orf64Q86WR6 236 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PSAT1Q9Y617 370 aa22.35■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MAP2K7O14733 419 aa22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 COX6A1P12074 109 aa22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 MGAT5Q09328 741 aa22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 DUPD1Q68J44 220 aa22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PPP1CC-211ENST00000620030 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms