RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G10O15496 165 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GPX5O75715 221 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ADRA2AP08913 450 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN19P0C672 248 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 G6PDP11413 515 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SOX3P41225 446 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3CGP48736 1102 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MAN2A2P49641 1150 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PER3P56645 1201 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM189BP81408 668 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 UGP2Q16851 508 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF284Q2VY69 593 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KCTD11Q693B1 232 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 METTL23Q86XA0 190 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PPTC7Q8NI37 304 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GGHQ92820 318 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SENP8Q96LD8 212 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ASPNQ9BXN1 380 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SRRQ9GZT4 340 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MROH8Q9H579 483 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KRT84Q9NSB2 600 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 AIG1Q9NVV5 245 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK1Q14185 1865 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LRRTM2O43300 516 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 IFNA16P05015 189 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CKMT1AP12532 417 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CAV3P56539 151 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 HERVK_113P63132 956 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ERVK-8P63133 956 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TNK1Q13470 666 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ING3Q9NXR8 418 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF222Q9UK12 451 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF98A6NK75 572 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 I6L893 689 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PLOD3O60568 738 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TBX18O95935 607 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GLAP06280 429 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 HTR6P50406 440 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PRKG2Q13237 762 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PTGR1Q14914 329 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RBBP7Q16576 425 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CPZQ66K79 652 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TEX261Q6UWH6 196 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD46Q86W74 232 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KIF18BQ86Y91 864 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TAGAPQ8N103 731 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF366Q8N895 744 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR8K3Q8NH51 312 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM203Q969S6 136 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC126Q96EE4 140 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FOPNLQ96NB1 174 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GHITMQ9H3K2 345 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 IFT46Q9NQC8 304 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms