RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 HNMTP50135 292 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 HKDC1Q2TB90 917 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 PTERQ96BW5 349 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CYTH2Q99418 400 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 FUT8Q9BYC5 575 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 ACSS3Q9H6R3 686 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 PCSK5Q92824 1860 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 RFPL1O75677 317 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CDH1P12830 882 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 ATP6V0D1P61421 351 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 FRA10AC1Q70Z53 315 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 OR4K1Q8NGD4 311 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CABS1Q96KC9 395 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 IP6K3Q96PC2 410 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 SARGQ9BW04 601 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 ZNF304Q9HCX3 659 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 UQCRHP07919 91 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CD1DP15813 335 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 GRK3P35626 688 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 OR1D4P47884 311 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 SLMAPQ14BN4 828 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 NKG7Q16617 165 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 VN1R4Q7Z5H5 301 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 DTWD1Q8N5C7 304 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 DOCK10Q96BY6 2186 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-220ENST00000618056 P2RX6O15547 441 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 UMODP07911 640 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CCR8P51685 355 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 FAM53BQ14153 422 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TGFBIQ15582 683 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 NACC2Q96BF6 587 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 RHBDF1Q96CC6 855 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SPSB2Q99619 263 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 EGFL8Q99944 293 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 VSTM2BA6NLU5 285 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 B8ZZF3 427 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ATXN8OSP0DMR3 200 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CRABP2P29373 138 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SLC26A3P40879 764 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 MED25Q71SY5 747 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CMC1Q7Z7K0 106 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 MRGPREQ86SM8 312 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 NEIL2Q969S2 332 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TRIM55Q9BYV6 548 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ING2Q9H160 280 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CTSFQ9UBX1 484 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ARGFXA6NJG6 315 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 OTX2P32243 289 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 BCL6P41182 706 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 NFATC3Q12968 1075 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ATP1A4Q13733 1029 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CSHL1Q14406 222 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CPZQ66K79 652 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1191Q96A73 305 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 COL26A1Q96A83 441 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 DRC3Q9H069 523 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TLK1Q9UKI8 766 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 HMX2A2RU54 273 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 15.6
PMS1-220ENST00000618056 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 ACSL3O95573 720 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A12P48065 614 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 CSRP3P50461 194 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 RRADP55042 308 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 FOXL2P58012 376 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 DSG2Q14126 1118 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 OR4D1Q15615 310 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 NDUFA9Q16795 377 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TCTN3Q6NUS6 607 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 RAPH1Q70E73 1250 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 GPSM1Q86YR5 675 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 IFT20Q8IY31 132 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-220ENST00000618056 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.68■■□□□ 1.38
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