RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THAP11Q96EK4 314 aa11.39□□□□□ -0.59
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RDH12Q96NR8 316 aa11.38□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.38□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FZD4Q9ULV1 537 aa11.38□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0YIV9 168 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC1A7O00341 560 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCKDKO14874 412 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINT1O43278 529 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INMTO95050 263 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOD1P00441 154 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP17A1P05093 508 aa11.37□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACPPP15309 386 aa11.37□□□□□ -0.59
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