RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF487	B1APH4	448 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC16A5	O15375	505 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PRMT3	O60678	531 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ANXA5	P08758	320 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GSTM1	P09488	218 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	UQCRC1	P31930	480 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	BDKRB1	P46663	353 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GSTM4	Q03013	218 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MESD	Q14696	234 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560		Q5PR19	223 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SHE	Q5VZ18	495 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TSLP	Q969D9	159 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FREM3	P0C091	2139 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NDC80	O14777	642 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PEX1	O43933	1283 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ACVR2A	P27037	513 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	EMP3	P54852	163 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560		Q96MF0	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DRC3	Q9H069	523 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560		H7C0S8	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CRLF1	O75462	422 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GPC4	O75487	556 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CRTAM	O95727	393 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	FTH1	P02794	183 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	KRT1	P04264	644 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	TACR1	P25103	407 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	PSMB4	P28070	264 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CYB561	P49447	251 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	MLF1	P58340	268 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	ELP5	Q8TE02	316 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	GBA3	Q9H227	469 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.34	□□□□□ -0.59
NUP62-216	ENST00000599560	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560		A0A0G2JMM0	328 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1W2PPB8	328 aa		11.33	□□□□□ -0.6
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1W2PRS3	328 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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