RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	CA14	Q9ULX7	337 aa		14.88	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	C7orf72	A4D263	438 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318		H3BMQ9	156 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ACOT8	O14734	319 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ULK1	O75385	1050 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	IGLV3-19	P01714	112 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TFPT	P0C1Z6	253 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PCYT1A	P49585	367 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CLDN2	P57739	230 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	STX1B	P61266	288 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FZD5	Q13467	585 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KIF19	Q2TAC6	998 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TEX37	Q96LM6	180 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	COG8	Q96MW5	612 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TPK1	Q9H3S4	243 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318		E7EQ34	232 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318		H0Y8X5	98 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	AQP9	O43315	295 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LAT	O43561	262 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ACP5	P13686	325 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MYF6	P23409	242 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TMBIM6	P55061	237 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NME5	P56597	212 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CHIT1	Q13231	466 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NR6A1	Q15406	480 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PYCR3	Q53H96	274 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SYT13	Q7L8C5	426 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MIER2	Q8N344	545 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKFN1	Q8N957	763 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MED8	Q96G25	268 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	BMF	Q96LC9	184 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NPAS2	Q99743	824 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CTRC	Q99895	268 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MRO	Q9BYG7	248 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	FGF22	Q9HCT0	170 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ASF1A	Q9Y294	204 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KRBA1	A5PL33	1030 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318		E7ENX8	843 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KDM1A	O60341	852 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	UGDH	O60701	494 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PDYN	P01213	254 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	JUP	P14923	745 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	GSS	P48637	474 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	DGKE	P52429	567 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TBPL1	P62380	186 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	HMGCS1	Q01581	520 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TAP2	Q03519	686 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	EMX2	Q04743	252 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	GRIK2	Q13002	908 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ART3	Q13508	389 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP1A4	Q13733	1029 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	E2F2	Q14209	437 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPRE2	Q15555	327 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	TFAP2C	Q92754	450 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SGPP1	Q9BX95	441 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ACPT	Q9BZG2	426 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR41	Q9HAD4	459 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SGK2	Q9HBY8	427 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CD320	Q9NPF0	282 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		14.86	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	PCM1	Q15154	2024 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LRP4	O75096	1905 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	LRRC72	A6NJI9	287 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF839	A8K0R7	811 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC28A1	O00337	649 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	ATE1	O95260	518 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	STAMBP	O95630	424 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT6A	P02538	564 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT6B	P04259	564 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC7A1	P30825	629 aa		14.85	□□□□□ -0.03
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT6C	P48668	564 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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