RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577198.5

KRT18P55-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT18P55, Length 1,950 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P55-201ENST00000577198 KLHL18O94889 574 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 IL10P22301 178 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PRKCQQ04759 706 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC14A1Q13336 389 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 MED21Q13503 144 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CYP2A13Q16696 494 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 REPS1Q96D71 796 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 MYOCQ99972 504 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 RMND5AQ9H871 391 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 A0A1W2PPV9 198 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 LYNP07948 512 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 UMPSP11172 480 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 LAMP1P11279 417 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 NRF1Q16656 503 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SPIN4Q56A73 249 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 APOOQ9BUR5 198 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 KCNK6Q9Y257 313 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.48■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 A6NHS1 94 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 GABRR3A8MPY1 467 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC31A1O15431 190 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TGFB1P01137 390 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PYCR3Q53H96 274 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 FAM124AQ86V42 546 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 OR51B5Q9H339 312 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 KCNK12Q9HB15 430 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PREBQ9HCU5 417 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 RAB26Q9ULW5 256 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SUFUQ9UMX1 484 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 V9GYQ6 96 aa20.47■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SOCS2O14508 198 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 COX7A2P14406 83 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 DRD1P21728 446 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 PSMB5P28074 263 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 HKDC1Q2TB90 917 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ZNF597Q96LX8 424 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SH3GL1Q99961 368 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TAC3Q9UHF0 121 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 INVSQ9Y283 1065 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 KLHL33A6NCF5 533 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TXNDC9O14530 226 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 RFXANKO14593 260 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 ANXA6P08133 673 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CCT8P50990 548 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CLCA4Q14CN2 919 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.46■□□□□ 0.87
KRT18P55-201ENST00000577198 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms