RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OXSM	Q9NWU1	459 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DUXA	A6NLW8	204 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ACR	P10323	421 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PLS3	P13797	630 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	AGXT	P21549	392 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DCTD	P32321	178 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PTGER4	P35408	488 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ID1	P41134	155 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CSK	P41240	450 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	HK3	P52790	923 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	IRF8	Q02556	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GPR153	Q6NV75	609 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	METTL7B	Q6UX53	244 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	USP30	Q70CQ3	517 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FBXO11	Q86XK2	927 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM129C	Q86XR2	697 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLCO2A1	Q92959	643 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	HAVCR1	Q96D42	359 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CHP1	Q99653	195 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RAB9B	Q9NP90	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ING3	Q9NXR8	418 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MIOX	Q9UGB7	285 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CDYL	Q9Y232	598 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KPTN	Q9Y664	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	XDH	P47989	1333 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LRCH4	O75427	683 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC3A	O75596	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM155B	O75949	473 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CNTN5	O94779	1100 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TJP3	O95049	919 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LY86	O95711	162 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TK1	P04183	234 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	HLA-DMA	P28067	261 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CYP2C18	P33260	490 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CNTN2	Q02246	1040 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DNASE1L3	Q13609	305 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	IL10RA	Q13651	578 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNMB1	Q16558	191 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ESCO2	Q56NI9	601 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ULK3	Q6PHR2	472 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	P2RX5	Q93086	422 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAM2	Q99965	735 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	BIN3	Q9NQY0	253 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	HEY2	Q9UBP5	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NARF	Q9UHQ1	456 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NACAD	O15069	1562 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CFLAR	O15519	480 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CHP2	O43745	196 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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