RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 HSPA7P48741 367 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CSNK1G2P78368 415 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 VAC14Q08AM6 782 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CDC16Q13042 620 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 NDUFA9Q16795 377 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MR1Q95460 341 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 GPR78Q96P69 363 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SARGQ9BW04 601 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 EHD1Q9H4M9 534 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PELI2Q9HAT8 420 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 OPTCQ9UBM4 332 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 A0A1B0GX78 115 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SMIM23A6NLE4 172 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 C9J4A7 227 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 K7ENP7 123 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 K7EPI3 171 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 DSCR3O14972 297 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 OR1F1O43749 312 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 KLK8O60259 260 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 KATNA1O75449 491 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 RECKO95980 971 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MTHFD2P13995 350 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LIFP15018 202 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 EPB42P16452 691 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TAC1P20366 129 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 GSTM2P28161 218 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 AHRP35869 848 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SLCO1A2P46721 670 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CCT5P48643 541 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PIK3CGP48736 1102 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MC1RQ01726 317 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 GPS2Q13227 327 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 LAPTM5Q13571 262 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SETDB1Q15047 1291 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PDK4Q16654 411 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PFKFB4Q16877 469 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MUM1Q2TAK8 710 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 ATG9BQ674R7 924 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CROCCP2Q86T23 111 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 KRT78Q8N1N4 520 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SNX31Q8N9S9 440 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TRPV3Q8NET8 790 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TTLQ8NG68 377 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 MVB12AQ96EY5 273 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CUTCQ9NTM9 273 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CROTQ9UKG9 612 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-224ENST00000551155 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms